宋佳明,四川巴中人,理学博士,含弘研究员,博士生导师。长期从事作物功能基因组学研究,围绕粮油作物重要农艺性状形成的遗传基础与演化规律开展系列研究。研究成果以第一或通讯作者在Nature Plants, The Plant Cell, Molecular Plant, Plant Biotechnology Journal, Plant Physiology等国际知名刊物发表,2篇入选ESI热点论文。入选中国科协“青年人才托举工程”项目,担任中国生化学会农业分会青年委员,Front Plant Sci编辑、Genome Biol、Plant Commun、Hortic Res等杂志审稿人。
研究方向
1. 油菜耐密高产基因挖掘和分子机制解析
2. 优异种质资源形成与演化机制
3. 基因组大数据辅助设计育种平台
教育经历
2011.09-2015.06:华中农业大学,生物信息学,本科/理学学士
2012.03-2015.06:华中科技大学,计算机科学与技术,双学位/工学学士
2019.02-2020.02:美国亚利桑那大学,基因组学,博士联培(导师:Rod A. Wing/张建伟)
2015.09-2020.06:华中农业大学,生物信息学,博士研究生/理学博士(导师:陈玲玲)
工作经历
2023.11-至今:西南大学农学与科技学院,含弘研究员
2020.08-2023.10:广西大学生命科学与技术学院,副教授
科研项目
中国科协“青年人才托举工程”项目(2022-2024),主持,在研
国家自然科学基金青年项目(2022-2024),主持,在研
国家重点实验室自主专项(2022-2024),主持,在研
国家重点实验室青年人才专项(2023-2025),主持,在研
西南大学高层次人才启动项目(2024-2028),主持,在研
近五年代表性论文(*:通讯作者;#共同第一作者)
1. Song, J. M.#, Guan, Z.#, Hu, J.#, Guo, C., Yang, Z., Wang, S., Liu, D., Wang, B., Lu, S., Zhou, R., Xie, W. Z., Cheng, Y., Zhang, Y., Liu, K.*, Yang, Q. Y.*, Chen, L. L.* & Guo, L.* (2020). Eight high-quality genomes reveal pan-genome architecture and ecotype differentiation of Brassica napus. Nature Plants, 1-12. (ESI热点论文,ResearchGate统计引用455次)
2. Song, J. M.#, Xie, W. Z.#, Wang, S.#, Guo, Y. X., Koo, D. H., Kudrna, D., Gong, C., Huang, Y., Feng, J. W., Zhang, W., Zhou, Y., Zuccolo, A., Long, E., Lee, S., Talag, J., Zhou, R., Zhu, X.T., Yuan, D., Udall, J., Xie, W., Wing R. A., Zhang Q., Poland J., Zhang J.*, Chen L. L.* (2021). Two gap-free reference genomes and a global view of the centromere architecture in rice. Molecular Plant, 14(10), 1757–1767. (ESI热点论文)
3. Song, J. M., Lei, Y., Shu, C. C., Ding, Y., Xing, F., Liu, H., Wang, J., Zhang, J. W.* & Chen, L.L.* (2018). Rice Information GateWay: a comprehensive bioinformatics platform for indica rice genomes. Molecular Plant, 11(3), 505-507.
4. Song, J. M.#, Liu, D. X.#, Xie, W. Z., Yang, Z., Guo, L., Liu, K., Yang, Q. Y.*, & Chen, L. L.* (2021). BnPIR: Brassica napus pan-genome information resource for 1689 accessions. Plant Biotechnology Journal, 19(3), 412–414.
5. Zhong, Y.#, Luo, Y.#, Sun, J.#, Qin, X., Gan, P., Zhou, Z., Qian, Q., Zhao, R., Zhao, Z., Cai, W., Luo, J.*, Chen, L.L.*, Song, J. M.* (2024). Pan-transcriptomic analysis of rice under cold stress reveals alternative splicing control of cold tolerance. The Plant Cell, koae039.
近三年其他论文(*:通讯作者;#共同第一作者)
1. Xu, X. D., Zhao, R. P., Xiao, L., Lu, L., Gao, M., Luo, Y. H., Zhou, Z. W., Ye, S. Y., Qian, Y. Q., Fan, B. L., Shang, X., Shi, P., Zeng, W., Cao, S., Wu, Z., Yan, H. *, Chen, L. L. *, & Song, J. M.* (2023). Telomere-to-telomere assembly of cassava genome reveals the evolution of cassava and divergence of allelic expression. Horticulture Research, 10(11), uhad200.
2. Wang, S.#, Qian, Y. Q.#, Zhao, R. P., Chen, L. L.*, & Song, J. M.* (2023). Graph-based pan-genomes: increased opportunities in plant genomics. Journal of Experimental Botany,74(1), 24–39.
3. Zheng, Y. Y.#, Chen, L. H.#, Fan, B. L.#, Xu, Z., Wang, Q., Zhao, B. Y., Gao, M., Yuan, M. H., Tahir Ul Qamar, M., Jiang, Y., Yang, L., Wang, L., Li, W., Cai, W., Ma, C., Lu, L., Song, J. M.*, & Chen, L. L.* (2023). Integrative multi-omics profiling of passion fruit reveals the genetic basis for fruit color and aroma. Plant Physiology, kiad640.
4. Xie, W. Z.#, Zheng, Y. Y.#, He, W., Bi, F., Li, Y., Dou, T., Zhou, R., Guo, Y. X., Deng, G., Zhang, W., Yuan, M. H., Sanz-Jimenez, P., Zhu, X. T., Xu, X. D., Zhou, Z. W., Zhou, Z. W., Feng, J. W., Liu, S., Li, C., Yang, Q., Hu, C., Gao, H., Dong, T., Dang, J., Guo, Q., Cai, W., Zhang, J., Yi, G., Song, J. M.*, Sheng, O. *, and Chen, L. L. * (2023). Two haplotype-resolved genome assemblies for AAB allotriploid bananas provide insights into banana subgenome asymmetric evolution and Fusarium wilt control. Plant Communications, 100766.
5. Wang, S.#, Qian, Y. Q.#, Zhao, R. P., Chen, L. L.*, & Song, J. M.* (2023). Graph-based pan-genomes: increased opportunities in plant genomics. Journal of Experimental Botany, 74(1), 24–39.
6. Zhou, Z. W., Yu, Z. G., Huang, X. M., Liu, J. S., Guo, Y. X., Chen, L. L.*, & Song, J. M.* (2022). GenomeSyn: a bioinformatics tool for visualizing genome synteny and structural variations. Journal of Genetics and Genomics, 49(12), 1174–1176.
7. Song, J. M.#, Zhang, Y.#, Zhou, Z. W., Lu, S., Ma, W., Lu, C., Chen, L. L.*, & Guo, L.* (2022). Oil plant genomes: current state of the science. Journal of Experimental Botany, 73(9), 2859–2874.
研究生、博士后招生
一)博士/硕士研究生
a. 具有推免资格或符合西南大学农生院“申请审核”制博士/硕士研究生招考要求;
b. 对科学研究充满热情,具有严谨的科学态度;
c. 善于沟通交流,有良好的责任心和团队协作精神。
二)博士后
a. 近期(或即将)取得遗传学、基因组学、生物信息学、分子生物学、计算机等相关领域的博士学位;
b. 以第一作者(含共同)发表过SCI论文,有一定的独立工作能力;
c. 拥有较为良好的英语沟通和写作能力;
d. 具备良好的团队合作精神和高度的责任心、较强的主观能动性;
e. 工资待遇参考按学校相关规定执行(http://rczp.swu.edu.cn/info/1006/1028.htm),其他福利待遇面议后根据应聘人员资历从优提供。
请有意者请将以下材料发送到电子邮箱:jmsong@swu.edu.cn
1. 详细的个人简历,包括学习工作经历、主要研究工作内容、代表性论文论著清单、获奖情况;
2. 个人学术水平相关材料,如代表性论文、学术奖励等。
联系方式
E-mail:jmsong@swu.edu.cn
通信地址:重庆市北碚区天生路2号73882必赢欢迎光临网址;邮编:400716